宁州刺史部在设立时包含四个郡，分别是：建宁郡、兴古郡、云南郡和永昌郡。这四个郡下属若干个县。以下是一些县名示例：

1. 建宁郡：包括建安、安宁、建水、石屏等县。

2. 兴古郡：包括晋宁、陆良、罗平、师宗等县。

3. 云南郡：包括昆明、寻甸、曲靖、武定等县。

4. 永昌郡：包括保山、腾冲、龙陵、盈江等

根据历史资料，以下是历任宁州刺史（部分任期不详）：

1. 鲜于婴（271年-274年）

2. 李毅（302年-306年）

3. 李秀（307年-309年）

4. 李钊（309年）

5. 王逊（310年-323年）

6. 王坚（323年-325年）

7. 尹奉（325年-333年）

8. 谢恕（335年-338年）

9. 爨（346年-348年）

10. 毛穆之（357年-362年）

11. 周仲孙（363年-371年）

12. 费统（375年-390年）

13. 桓安民（392年）

14. 毛璠（397年-404年）

15. 毛瑗（405年）

16. 朱客子（411年-414年）

17. 刘宋宁州刺史应袭（422年-427年）

18. 周籍之（428年-430年）

19. 徐循（438年-439年）