曹文诏大声说道：＂今后水师提督衙门就设在澎湖岛上了。“

岛上原有一万来人，因不堪倭子、佛朗机、红毛夷隔三差五的骚扰劫掠，纷纷跑到附近小岛上了。

他们听说朝廷要将提督衙门建在澎湖岛上，都想倚靠大树乘凉，又纷纷跑了回来。

孙传庭发布通告，让福建沿海渔民都迁到澎湖岛上去，方便朝廷对他们提供保护。

一个多月的功夫，岛上竟然聚集了七八万渔民。

孙传庭登上澎湖岛，带领官兵和渔民在岛上修筑堡寨、挖井、煮盐。余咨皋则训练宣大兵。

朱由检好容易筹集了七十五万两银子，四万石粮食，造了四十条大船，每条船上配五十条火铳，十二门火炮，送往澎湖。

他指示孙传庭，下一步登陆东番岛，驱逐岛西部的荷兰人，岛北部的西班牙人，全面控制日本的海上贸易。

曹文诏、曹变蛟每天带领船只在澎湖附近海域游弋，一有商船经过，便将船拦截，凡不购买总督衙门令牌，一律连船带货带人扣留。

最横的是荷兰商船，老远就向福建水师开炮。余咨皋率领四五十条船，将荷兰商船层层围住。荷兰商船续继开炮，击沉福建水师两条船。

曹文诏、曹变蛟驾着一艘小船，绕到荷兰商船背后，强行登船。曹文诏、曹变蛟端看机关枪，将船上水兵七十人，水手十六人，商人四名，全部打死，将船和货物全部扣留。

血案发生后，孙传庭命令封锁东番海峡，要求荷兰赔偿白银一百八十万两，禁止一切外国商船通过。

荷兰、西班牙、葡萄牙通往日本的航运路线被切断，货物不能如期交付，损失惨重。

他们联合起来，找到郑芝龙，向他施压：＂你收了我们的保护费，却不能保护我们。在这片海峡，你们究竟谁才是老大？＂

郑芝龙损失惨重，怒冲冲找到熊文灿，说道：＂当初朝廷招安，许下的诺言还算数吗？打刘香，我可是出了力的。朝廷这样做，是想将我一脚踢开吗？如果是的话，熊巡抚说一句话。如果不是的话，今后凡有郑家令牌的商船，总督衙门一律不得阻挠通过。＂

熊文灿深知郑芝龙的厉害，答道：＂你也知道，现在福建说了算的人不是我，你问的问题，我管复不了你。＂

郑芝龙道：＂那由我作东，请孙总督、熊巡抚一聚。＂