“我认为这可能是因为十八芝的主力作战部队已经撤走了。”钱天敦发表了自己的看法：“想必郑芝龙现在已经不在马公港了，不然也不至于乱成这样，这分明就是树倒猢狲散的景象。”

钱天敦所料的确不差，郑芝龙在派出了第二支船队后不久，便离开了马公港。不过他并不是从这里乘船出海，而是折向澎湖岛内陆，横穿澎湖之后，在岛东北端的白坑渔村搭船出海。

郑芝龙之所以选择这种比较麻烦的撤离方式，也是有他自己的安全考虑在里面。首先如果他在众目睽睽之下从马公港率先离开，那么对于仍然没有来得及撤离的人员来说无疑会有一种被抛弃的感受，很容易引发大的混乱不说，而且对他个人在十八芝中的形象也会起到负面影响。其次他很担心对手的船队随时杀到马公港，那时候即便船已经出海，也很难逃过海汉人那种高速战船的衔尾追杀，因此他选择了从澎湖岛的另一头出海，在离开澎湖海域之后再寻求与大部队的会合。

值得庆幸的是郑芝龙所派出的两支阻击船队虽然都很快战败，但的确为十八芝争取到了非常宝贵的一段撤离时间，岛上的青壮几乎都已经在联军舰队抵达之前一个小时撤离了马公港，以最快的速度往北方逃窜。被联军舰队堵在马公港的，几乎都是散兵游勇和装载闲散人员的船只了。

“追吗？”王汤姆看着已经接触到海平面的夕阳，征询颜楚杰和钱天敦的意见。

“算了，安全第一。今天还是先把马公港清理下来再说，明天再派船队去撵一撵十八芝的屁股吧。”颜楚杰稍一犹豫，最后还是选择了放弃追击。

钱天敦对此也持比较慎重的态度：“这里岛屿众多，我们对澎湖附近的海域又不熟悉，打夜战太冒险了，也没有冒这个风险的必要。还是先缓一缓，等明天再让舰队清理附近海域。”

两名同僚都建议稳重应对，王汤姆也不会坚持冒险作战，当下便通过电台通知另外两支舰队，让他们收拢队伍，开始对马公港码头进行清理。同时派船通知福建水师，让他们派船往南北两个方向沿海岸线进行搜索，看看澎湖岛沿岸是否还有尚未来得及撤离的海盗船队。

在意识到大势已去之后，滞留在马公港未能来得及撤离的数千人没有再进行无谓的抵抗，大约三分之一的人选择了就地投降，剩下的人则是抱着侥幸心理撤向了内陆，指望敌人对澎湖的攻打只是短期行为，打完这一波之后就会撤回大陆。

颜楚杰也没有急于让部队连夜进行搜捕，而是在马公港划定了驻扎区，让运兵船和货船能偶尽快入港停靠。这次的联合行动，海汉与福建军方总共投入了近万作战人员，还动员了几乎数目相当的民夫负责后勤辎重。不过开战之前的种种担心，现在看来都已经不会出现了，十八芝接连驶出丢车保帅的招数，已经表明了他们没有打算在澎湖岛上再组织像样的抵抗。这样一来联军要实现占领澎湖的作战意图就十分轻松了，只要逐岛进行清理就行。

在军官们上岸享用晚餐的时候，福建水师送来了另一个消息，根据之前海战所俘获的海盗交代，下午在海上交手的第二波海盗船是由十八芝首领之一的郑芝莞指挥，而郑芝莞本人的坐船已经在交战中被海汉舰队用火炮击沉，估计是不太可能生还了。至此十八芝的首领中已经有三人战死，三人被擒，这个战果已经足以让福建官府对朝廷和兵部都有所交代了。

入夜之后，许心素为首的福建军方高层也全部在马公港登陆上岸，与海汉指挥人员磋商接下来的行动安排。